Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC127Q96BQ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC127Q96BQ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC127Q96BQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC127Q96BQ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC127Q96BQ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC127Q96BQ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms