Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP53INP1Q96A56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP53INP1Q96A56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP53INP1Q96A56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TP53INP1Q96A56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP53INP1Q96A56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms