Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NXPE3Q969Y0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NXPE3Q969Y0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NXPE3Q969Y0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NXPE3Q969Y0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NXPE3Q969Y0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NXPE3Q969Y0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms