Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NINJ1Q92982 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ1Q92982 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NINJ1Q92982 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NINJ1Q92982 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NINJ1Q92982 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms