Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXTL1Q92935 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXTL1Q92935 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXTL1Q92935 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXTL1Q92935 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXTL1Q92935 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXTL1Q92935 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms