Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TNRQ92752 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TNRQ92752 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TNRQ92752 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TNRQ92752 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TNRQ92752 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TNRQ92752 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TNRQ92752 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TNRQ92752 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
TNRQ92752 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNRQ92752 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNRQ92752 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNRQ92752 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNRQ92752 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TNRQ92752 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNRQ92752 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNRQ92752 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNRQ92752 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
TNRQ92752 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TNRQ92752 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNRQ92752 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNRQ92752 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNRQ92752 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TNRQ92752 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
TNRQ92752 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
TNRQ92752 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TNRQ92752 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TNRQ92752 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TNRQ92752 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TNRQ92752 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNRQ92752 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNRQ92752 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNRQ92752 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNRQ92752 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TNRQ92752 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNRQ92752 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNRQ92752 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNRQ92752 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TNRQ92752 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TNRQ92752 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TNRQ92752 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNRQ92752 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNRQ92752 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNRQ92752 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNRQ92752 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TNRQ92752 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNRQ92752 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNRQ92752 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TNRQ92752 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TNRQ92752 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TNRQ92752 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TNRQ92752 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TNRQ92752 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNRQ92752 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TNRQ92752 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNRQ92752 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNRQ92752 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNRQ92752 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNRQ92752 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TNRQ92752 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNRQ92752 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNRQ92752 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNRQ92752 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TNRQ92752 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNRQ92752 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNRQ92752 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNRQ92752 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNRQ92752 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TNRQ92752 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TNRQ92752 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNRQ92752 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TNRQ92752 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
TNRQ92752 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNRQ92752 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNRQ92752 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TNRQ92752 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
TNRQ92752 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
TNRQ92752 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TNRQ92752 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNRQ92752 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TNRQ92752 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TNRQ92752 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TNRQ92752 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TNRQ92752 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TNRQ92752 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TNRQ92752 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms