Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRUQ92729 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRUQ92729 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRUQ92729 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRUQ92729 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRUQ92729 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRUQ92729 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PTPRUQ92729 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRUQ92729 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms