Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ60

KLHL6, Kelch-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL6Q8WZ60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL6Q8WZ60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL6Q8WZ60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL6Q8WZ60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL6Q8WZ60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL6Q8WZ60 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL6Q8WZ60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL6Q8WZ60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms