Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCG3Q8WXD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCG3Q8WXD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCG3Q8WXD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCG3Q8WXD2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCG3Q8WXD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms