Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNE4Q8WWG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNE4Q8WWG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNE4Q8WWG9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNE4Q8WWG9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNE4Q8WWG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNE4Q8WWG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms