Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTV0

SCARB1, Scavenger receptor class B member 1, humanhuman

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1Q8WTV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB1Q8WTV0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB1Q8WTV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARB1Q8WTV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCARB1Q8WTV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB1Q8WTV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB1Q8WTV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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