Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TMC1Q8TDI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TMC1Q8TDI8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TMC1Q8TDI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TMC1Q8TDI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TMC1Q8TDI8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TMC1Q8TDI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TMC1Q8TDI8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms