Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF398Q8TD17 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF398Q8TD17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF398Q8TD17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF398Q8TD17 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF398Q8TD17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms