Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM71BQ8TC56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM71BQ8TC56 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM71BQ8TC56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FAM71BQ8TC56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM71BQ8TC56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms