Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNFQ8TB73 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNFQ8TB73 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDNFQ8TB73 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDNFQ8TB73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms