Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP2Q8NFZ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP2Q8NFZ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP2Q8NFZ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNIP2Q8NFZ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNIP2Q8NFZ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNIP2Q8NFZ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNIP2Q8NFZ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP2Q8NFZ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNIP2Q8NFZ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNIP2Q8NFZ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms