Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF680Q8NEM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF680Q8NEM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF680Q8NEM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF680Q8NEM1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms