Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1NQ8N819 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1NQ8N819 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPM1NQ8N819 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1NQ8N819 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1NQ8N819 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1NQ8N819 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1NQ8N819 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms