Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNYL1Q8N7R7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNYL1Q8N7R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNYL1Q8N7R7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNYL1Q8N7R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNYL1Q8N7R7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNYL1Q8N7R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNYL1Q8N7R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNYL1Q8N7R7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms