Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN22Q8N7P3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN22Q8N7P3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN22Q8N7P3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN22Q8N7P3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN22Q8N7P3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms