Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML2Q8N7C3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML2Q8N7C3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML2Q8N7C3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML2Q8N7C3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIML2Q8N7C3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 678 ms