Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCO5AQ8N6Q1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCO5AQ8N6Q1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCO5AQ8N6Q1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO5AQ8N6Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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