Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC155Q8N6L0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC155Q8N6L0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC155Q8N6L0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC155Q8N6L0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC155Q8N6L0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms