Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC33Q8N5R6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC33Q8N5R6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC33Q8N5R6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms