Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PNKDQ8N490 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNKDQ8N490 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PNKDQ8N490 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PNKDQ8N490 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PNKDQ8N490 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNKDQ8N490 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNKDQ8N490 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNKDQ8N490 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNKDQ8N490 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNKDQ8N490 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNKDQ8N490 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNKDQ8N490 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNKDQ8N490 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNKDQ8N490 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNKDQ8N490 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNKDQ8N490 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNKDQ8N490 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNKDQ8N490 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNKDQ8N490 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNKDQ8N490 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNKDQ8N490 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms