Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHTF2Q8N3S3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHTF2Q8N3S3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHTF2Q8N3S3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHTF2Q8N3S3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHTF2Q8N3S3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHTF2Q8N3S3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms