Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NPAS3Q8IXF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NPAS3Q8IXF0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPAS3Q8IXF0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NPAS3Q8IXF0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NPAS3Q8IXF0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NPAS3Q8IXF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPAS3Q8IXF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283 ms