Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD302Q8IX05 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD302Q8IX05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD302Q8IX05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD302Q8IX05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD302Q8IX05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD302Q8IX05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CD302Q8IX05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms