Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROCCP3Q8IVE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCP3Q8IVE0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCP3Q8IVE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCP3Q8IVE0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROCCP3Q8IVE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CROCCP3Q8IVE0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CROCCP3Q8IVE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CROCCP3Q8IVE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCP3Q8IVE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCP3Q8IVE0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms