Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y25

ZNF354C, Zinc finger protein 354C, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354CQ86Y25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF354CQ86Y25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF354CQ86Y25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF354CQ86Y25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZNF354CQ86Y25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF354CQ86Y25 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms