Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD163Q86VB7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD163Q86VB7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD163Q86VB7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD163Q86VB7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD163Q86VB7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms