Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SLC51AQ86UW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SLC51AQ86UW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLC51AQ86UW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC51AQ86UW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC51AQ86UW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
SLC51AQ86UW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC51AQ86UW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms