Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC84Q86UT8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC84Q86UT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC84Q86UT8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC84Q86UT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC84Q86UT8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC84Q86UT8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms