Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLCO6A1Q86UG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLCO6A1Q86UG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLCO6A1Q86UG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLCO6A1Q86UG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLCO6A1Q86UG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLCO6A1Q86UG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLCO6A1Q86UG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO6A1Q86UG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO6A1Q86UG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms