Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD5

SLC9B2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B2Q86UD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9B2Q86UD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9B2Q86UD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9B2Q86UD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC9B2Q86UD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms