Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAINQ86UA6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAINQ86UA6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAINQ86UA6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPAINQ86UA6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPAINQ86UA6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPAINQ86UA6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPAINQ86UA6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAINQ86UA6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAINQ86UA6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms