Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX20Q7Z614 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX20Q7Z614 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX20Q7Z614 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX20Q7Z614 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX20Q7Z614 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX20Q7Z614 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms