Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2Z1

TICRR, Treslin, humanhuman

Predictions only

Length 1,910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TICRRQ7Z2Z1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TICRRQ7Z2Z1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TICRRQ7Z2Z1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TICRRQ7Z2Z1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TICRRQ7Z2Z1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TICRRQ7Z2Z1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TICRRQ7Z2Z1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TICRRQ7Z2Z1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms