Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP2Q7L804 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP2Q7L804 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB11FIP2Q7L804 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11FIP2Q7L804 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11FIP2Q7L804 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11FIP2Q7L804 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms