Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF165Q6ZSG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF165Q6ZSG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF165Q6ZSG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF165Q6ZSG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF165Q6ZSG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms