Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC73Q6ZRK6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC73Q6ZRK6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC73Q6ZRK6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC73Q6ZRK6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC73Q6ZRK6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC73Q6ZRK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC73Q6ZRK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms