Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY4Q6ZNE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY4Q6ZNE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY4Q6ZNE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RUFY4Q6ZNE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUFY4Q6ZNE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms