Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMV7

LEKR1, Leucine-, glutamate- and lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEKR1Q6ZMV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LEKR1Q6ZMV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LEKR1Q6ZMV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LEKR1Q6ZMV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LEKR1Q6ZMV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LEKR1Q6ZMV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms