Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD1Q6UWL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD1Q6UWL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SUSD1Q6UWL2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD1Q6UWL2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD1Q6UWL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms