Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C19orf48Q6RUI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C19orf48Q6RUI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C19orf48Q6RUI8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C19orf48Q6RUI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C19orf48Q6RUI8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C19orf48Q6RUI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms