Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT18Q6P9A2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GALNT18Q6P9A2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GALNT18Q6P9A2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GALNT18Q6P9A2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALNT18Q6P9A2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GALNT18Q6P9A2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALNT18Q6P9A2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms