Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP4Q6FHJ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFRP4Q6FHJ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFRP4Q6FHJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms