Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms