Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
C9orf84Q5VXU9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
C9orf84Q5VXU9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
C9orf84Q5VXU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
C9orf84Q5VXU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
C9orf84Q5VXU9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
C9orf84Q5VXU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
C9orf84Q5VXU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
C9orf84Q5VXU9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
C9orf84Q5VXU9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms