Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LIN9Q5TKA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LIN9Q5TKA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIN9Q5TKA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LIN9Q5TKA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms